MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014002	TAT	2	6	432013	432018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014002	AACA	2	8	432069	432076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_014002	GAG	2	6	432101	432106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014002	AGT	2	6	432129	432134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014002	TTC	2	6	432273	432278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_014002	CTATG	2	10	432288	432297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_014002	TGC	2	6	432360	432365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014002	CTGG	2	8	432517	432524	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_014002	AAT	2	6	432539	432544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014002	CTTT	2	8	432588	432595	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_014002	GT	3	6	432686	432691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014002	TAGCT	2	10	432736	432745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_014002	TGG	2	6	432746	432751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014002	CCA	2	6	432800	432805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_014002	TCT	2	6	432831	432836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014002	TA	3	6	432873	432878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014002	ATA	2	6	432887	432892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014002	AT	3	6	432907	432912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014002	TA	3	6	432919	432924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014002	ATT	2	6	432947	432952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014002	T	6	6	433354	433359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014002	T	6	6	433384	433389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014002	CAT	2	6	433442	433447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014002	AT	3	6	433466	433471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014002	TA	3	6	433492	433497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014002	ATT	2	6	439616	439621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014002	TA	3	6	439743	439748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014002	TAA	2	6	439774	439779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014002	TCC	2	6	441387	441392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_014002	T	6	6	441397	441402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014002	CCA	2	6	441421	441426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_014002	TGCT	2	8	441436	441443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_014002	ATTT	2	8	441453	441460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014002	GTAG	2	8	445929	445936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014002	TTTAT	2	10	445953	445962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014002	ATT	2	6	445972	445977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014002	T	6	6	446582	446587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_014002	ATT	3	9	446629	446637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_014002	CAA	2	6	446758	446763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_014002	CT	3	6	446775	446780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_014002	TAT	2	6	446792	446797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014002	GAT	2	6	446804	446809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_014002	AATA	2	8	449317	449324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014002	CAG	2	6	449425	449430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1050	NC_014002	ATG	2	6	449669	449674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014002	TGT	2	6	449690	449695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014002	GGT	2	6	449960	449965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014002	TATTC	2	10	450045	450054	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_014002	AAT	2	6	450095	450100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014002	ATCG	2	8	450109	450116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_014002	AATATT	2	12	450126	450137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014002	A	7	7	450162	450168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014002	TA	3	6	450227	450232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014002	T	6	6	450902	450907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014002	AATTA	2	10	450920	450929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014002	ATA	2	6	450938	450943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014002	AATTG	2	10	450944	450953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014002	TAA	2	6	450973	450978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014002	AGAAT	2	10	451009	451018	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014002	GAA	2	6	451035	451040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014002	TGA	2	6	451054	451059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014002	ACT	2	6	451065	451070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_014002	ATT	2	6	451119	451124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014002	A	6	6	451128	451133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_014002	CAA	2	6	451262	451267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_014002	TTAATC	2	12	451308	451319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1084	NC_014002	ATT	2	6	455754	455759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014002	AAT	2	6	455859	455864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014002	T	7	7	455882	455888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_014002	ACT	2	6	456100	456105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014002	TCA	2	6	456130	456135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014002	TAGGA	2	10	456154	456163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_014002	ATTT	2	8	456247	456254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014002	TTC	2	6	456266	456271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_014002	TAA	2	6	456274	456279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_014002	GTA	2	6	456318	456323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014002	ATAG	2	8	456423	456430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014002	GA	3	6	459649	459654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014002	T	6	6	459831	459836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014002	AT	4	8	460340	460347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014002	CAA	2	6	460349	460354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014002	GAA	2	6	460401	460406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014002	TCC	2	6	460433	460438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_014002	TGG	2	6	463905	463910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014002	A	6	6	463986	463991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1107	NC_014002	TATTTT	2	12	464568	464579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014002	TAT	2	6	464635	464640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014002	GTT	2	6	465967	465972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014002	T	6	6	466038	466043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014002	GAG	2	6	466066	466071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014002	TC	3	6	466128	466133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_014002	CT	3	6	469034	469039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_014002	AAT	2	6	469104	469109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014002	A	6	6	469153	469158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014002	AAT	2	6	469167	469172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014002	T	6	6	469183	469188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014002	TGA	2	6	469241	469246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014002	A	6	6	469255	469260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014002	AAG	2	6	469404	469409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014002	ATC	2	6	470659	470664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_014002	TCC	2	6	470764	470769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_014002	AAAC	2	8	470803	470810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_014002	AT	3	6	470839	470844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014002	ATA	2	6	470846	470851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014002	TTG	2	6	470876	470881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014002	TTTTA	2	10	470918	470927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014002	A	6	6	470943	470948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014002	AT	3	6	470962	470967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014002	TA	3	6	470979	470984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014002	TG	3	6	471019	471024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014002	TAA	2	6	471031	471036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014002	ATCTT	2	10	471901	471910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_014002	TA	3	6	472474	472479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014002	TGG	2	6	474494	474499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1278	NC_014002	TCC	2	6	500036	500041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1279	NC_014002	ATG	2	6	500043	500048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_014002	TGATG	2	10	500072	500081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_014002	A	6	6	500193	500198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_014002	CT	3	6	500245	500250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1283	NC_014002	TGG	2	6	500275	500280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1284	NC_014002	TG	3	6	500322	500327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1285	NC_014002	AAT	2	6	500473	500478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_014002	GTA	2	6	538832	538837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1408	NC_014002	T	6	6	543662	543667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_014002	ATTT	2	8	543668	543675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_014002	TA	3	6	543676	543681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_014002	TA	4	8	543720	543727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_014002	ATGA	2	8	544792	544799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_014002	ATTC	2	8	544917	544924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_014002	TGT	2	6	544947	544952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_014002	TG	3	6	544966	544971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_014002	T	7	7	545002	545008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_014002	ATG	2	6	546298	546303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_014002	TTGT	2	8	546315	546322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_014002	AGT	2	6	546323	546328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_014002	TTG	2	6	546344	546349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_014002	TA	3	6	546421	546426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_014002	A	6	6	546580	546585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_014002	T	6	6	546597	546602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_014002	AAG	2	6	546960	546965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_014002	GGA	2	6	555077	555082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_014002	CTT	2	6	558325	558330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_014002	AAC	2	6	558363	558368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_014002	TAA	2	6	558389	558394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_014002	GAAT	2	8	559716	559723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_014002	CT	3	6	560047	560052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1437	NC_014002	ATGT	2	8	560089	560096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_014002	TATT	2	8	560114	560121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_014002	CTT	2	6	560129	560134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_014002	TTC	2	6	560456	560461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_014002	ATGA	2	8	560484	560491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_014002	T	7	7	560496	560502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_014002	TTTG	2	8	560529	560536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_014002	GTT	2	6	560757	560762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_014002	CG	3	6	560826	560831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1449	NC_014002	TCTG	2	8	560883	560890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1450	NC_014002	AC	3	6	560891	560896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1451	NC_014002	GTTA	2	8	560924	560931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_014002	TGT	2	6	560970	560975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_014002	CAA	2	6	560992	560997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1455	NC_014002	CTA	2	6	561285	561290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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